|
|
Computational methods in single molecule localization microscopy
Ovesný, Martin ; Hagen, Guy Michael (vedoucí práce) ; Plášek, Jaromír (oponent) ; Fliegel, Karel (oponent)
Výpočetní metody v jednomolekulové lokalizační mikroskopii Abstrakt Fluorescenční mikroskopie je jedním z hlavních nástrojů biomedicínského výzkumu díky tomu, že se jedná o neinvazivní nedestruktivní a vysoce specifickou zobrazovací metodu. Bohužel optický mikroskop je difrakčně limitovaný systém, což znamená, že nejvyšší dosažitelné rozlišení je přibližně 250 nm laterálně a 500 nm axiálně. Jelikož většina buněčných struktur, o které se výzkumníci zajímají, je menší, zvýšení rozlišovací schopnosti je velice důležité. V posledních letech bylo vyvinuto několik metod, které umožňují zobrazování za hranicí difrakce. Jednou z nich je jednomolekulová lokalizační mikroskopie, která dokáže rozlišit detaily až do 5nm. Tato metoda je však velmi výpočetně náročná. Vývoj metod pro zobrazování a analýzu dat z jednomolekulové lokalizační mikroskopie je předmětem této práce. V lokalizační mikroskopii je obraz se superrozlišením zrekonstruován z dlouhé sekvence kon- venčních obrázků jednotlivých řídce distribuovaných fotoaktivovaných molekul. Ty jsou systematicky lokalizovány se subdifrakční přesností. V této práci jsme navrhli, implementovali a experimen- tálně ověřili sadu metod pro automatické zpracování, analýzu a vizualizaci dat pořízených jed- nomolekulovou lokalizační mikroskopií....
|
|
|
Hybrid Methods for Nonlinear Least Squares Problems
Lukšan, Ladislav ; Matonoha, Ctirad ; Vlček, Jan
This contribution contains a description and analysis of effective methods for minimization of the nonlinear least squares function F(x) = (1=2)fT (x)f(x), where x ∈ Rn and f ∈ Rm, together with extensive computational tests and comparisons of the introduced methods. All hybrid methods are described in detail and their global convergence is proved in a unified way. Some proofs concerning trust region methods, which are difficult to find in the literature, are also added. In particular, the report contains an analysis of a new simple hybrid method with Jacobian corrections (Section 8) and an investigation of the simple hybrid method for sparse least squares problems proposed previously in [33] (Section 14).
Plný tet: 0504615-av1 -  PDF
Plný text: content.csg - PDF
|
|
|
Nonparametric density estimates used for multiple AE source detection
Gális, P. ; Chlada, Milan
Paper deals with the localization of acoustic emission (AE) sources by means of exact geodesic curves on 3D vessels composed of several parametrized surfaces. Precise arrival times of AE events, plugged in DeltaT/DeltaL localization is discussed. Two-dimensional nonparametric (kernel) density estimates are employed to obtain the localization maps on 3-D surfaces and the potential regions of cracks are visibly highlighted. This newly proposed procedure is applied to steam reservoir and other experimental vessels. The results presented are accompanied by thoroughgoing evaluation of their quality and practical usefulness.
|
|
| |
|
| |
|
|
Computational methods in single molecule localization microscopy
Ovesný, Martin ; Hagen, Guy Michael (vedoucí práce) ; Plášek, Jaromír (oponent) ; Fliegel, Karel (oponent)
Výpočetní metody v jednomolekulové lokalizační mikroskopii Abstrakt Fluorescenční mikroskopie je jedním z hlavních nástrojů biomedicínského výzkumu díky tomu, že se jedná o neinvazivní nedestruktivní a vysoce specifickou zobrazovací metodu. Bohužel optický mikroskop je difrakčně limitovaný systém, což znamená, že nejvyšší dosažitelné rozlišení je přibližně 250 nm laterálně a 500 nm axiálně. Jelikož většina buněčných struktur, o které se výzkumníci zajímají, je menší, zvýšení rozlišovací schopnosti je velice důležité. V posledních letech bylo vyvinuto několik metod, které umožňují zobrazování za hranicí difrakce. Jednou z nich je jednomolekulová lokalizační mikroskopie, která dokáže rozlišit detaily až do 5nm. Tato metoda je však velmi výpočetně náročná. Vývoj metod pro zobrazování a analýzu dat z jednomolekulové lokalizační mikroskopie je předmětem této práce. V lokalizační mikroskopii je obraz se superrozlišením zrekonstruován z dlouhé sekvence kon- venčních obrázků jednotlivých řídce distribuovaných fotoaktivovaných molekul. Ty jsou systematicky lokalizovány se subdifrakční přesností. V této práci jsme navrhli, implementovali a experimen- tálně ověřili sadu metod pro automatické zpracování, analýzu a vizualizaci dat pořízených jed- nomolekulovou lokalizační mikroskopií....
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.